Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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Clcn1Q64347 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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Clcn1Q64347 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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Clcn1Q64347 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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Clcn1Q64347 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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Clcn1Q64347 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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Clcn1Q64347 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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Clcn1Q64347 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clcn1Q64347 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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Clcn1Q64347 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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Clcn1Q64347 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
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Clcn1Q64347 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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Clcn1Q64347 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
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Clcn1Q64347 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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Clcn1Q64347 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn1Q64347 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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