Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf4Q64310 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms