Protein–RNA interactions for Protein: Q64163

Tfdp2, Transcription factor Dp-2, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp2Q64163 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfdp2Q64163 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tfdp2Q64163 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfdp2Q64163 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms