Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pan3Q640Q5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pan3Q640Q5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pan3Q640Q5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms