Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Zfp248Q640N4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp248Q640N4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Zfp248Q640N4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Zfp248Q640N4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Zfp248Q640N4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Zfp248Q640N4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp248Q640N4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zfp248Q640N4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zfp248Q640N4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zfp248Q640N4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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