Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PatjQ63ZW7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PatjQ63ZW7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PatjQ63ZW7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms