Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a5Q63ZW6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col4a5Q63ZW6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a5Q63ZW6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms