Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CochQ62507 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CochQ62507 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CochQ62507 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CochQ62507 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CochQ62507 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CochQ62507 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CochQ62507 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CochQ62507 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CochQ62507 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CochQ62507 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CochQ62507 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CochQ62507 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CochQ62507 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CochQ62507 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CochQ62507 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CochQ62507 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CochQ62507 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CochQ62507 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CochQ62507 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CochQ62507 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CochQ62507 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CochQ62507 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CochQ62507 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CochQ62507 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CochQ62507 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CochQ62507 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CochQ62507 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CochQ62507 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CochQ62507 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CochQ62507 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CochQ62507 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CochQ62507 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CochQ62507 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CochQ62507 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CochQ62507 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CochQ62507 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CochQ62507 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CochQ62507 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CochQ62507 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CochQ62507 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CochQ62507 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CochQ62507 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CochQ62507 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CochQ62507 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CochQ62507 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CochQ62507 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CochQ62507 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CochQ62507 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CochQ62507 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CochQ62507 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CochQ62507 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CochQ62507 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CochQ62507 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CochQ62507 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CochQ62507 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CochQ62507 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CochQ62507 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CochQ62507 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CochQ62507 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CochQ62507 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CochQ62507 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CochQ62507 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CochQ62507 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CochQ62507 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CochQ62507 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CochQ62507 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CochQ62507 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CochQ62507 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CochQ62507 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CochQ62507 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CochQ62507 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CochQ62507 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CochQ62507 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CochQ62507 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CochQ62507 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms