Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps72Q62481 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms