Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndrg1Q62433 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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