Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sall3Q62255 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sall3Q62255 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sall3Q62255 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms