Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC40.01■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Kdm5dQ62240 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Kdm5dQ62240 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Kdm5dQ62240 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Kdm5dQ62240 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms