Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SnrpaQ62189 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SnrpaQ62189 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SnrpaQ62189 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms