Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx3xQ62167 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms