Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf1Q61999 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf1Q61999 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms