Protein–RNA interactions for Protein: Q61923

Kcna6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna6Q61923 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kcna6Q61923 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcna6Q61923 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcna6Q61923 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms