Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IbspQ61711 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IbspQ61711 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IbspQ61711 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IbspQ61711 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IbspQ61711 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IbspQ61711 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IbspQ61711 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms