Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gli3Q61602 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gli3Q61602 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gli3Q61602 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms