Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itm2aQ61500 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itm2aQ61500 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms