Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AlcamQ61490 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
AlcamQ61490 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AlcamQ61490 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms