Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2bQ61313 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2bQ61313 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms