Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcf12Q61286 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcf12Q61286 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms