Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nell2Q61220 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nell2Q61220 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nell2Q61220 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms