Protein–RNA interactions for Protein: Q61180

Scnn1a, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1aQ61180 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scnn1aQ61180 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scnn1aQ61180 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1aQ61180 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scnn1aQ61180 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scnn1aQ61180 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms