Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psen2Q61144 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psen2Q61144 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psen2Q61144 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psen2Q61144 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psen2Q61144 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psen2Q61144 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms