Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc6Q61143 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc6Q61143 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc6Q61143 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms