Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17laQ61068 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17laQ61068 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17laQ61068 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17laQ61068 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17laQ61068 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17laQ61068 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17laQ61068 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17laQ61068 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17laQ61068 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp17laQ61068 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp17laQ61068 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms