Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc1Q61056 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc1Q61056 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc1Q61056 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc1Q61056 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc1Q61056 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc1Q61056 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc1Q61056 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc1Q61056 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc1Q61056 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc1Q61056 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms