Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DbpQ60925 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DbpQ60925 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DbpQ60925 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DbpQ60925 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbpQ60925 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbpQ60925 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbpQ60925 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbpQ60925 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms