Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc6a4Q60857 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a4Q60857 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc6a4Q60857 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms