Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HellsQ60848 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HellsQ60848 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HellsQ60848 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HellsQ60848 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HellsQ60848 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HellsQ60848 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HellsQ60848 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HellsQ60848 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HellsQ60848 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HellsQ60848 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HellsQ60848 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HellsQ60848 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HellsQ60848 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HellsQ60848 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HellsQ60848 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms