Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NfkbibQ60778 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfkbibQ60778 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfkbibQ60778 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms