Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkn2dQ60773 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2dQ60773 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms