Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samhd1Q60710 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms