Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd4Q60688 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd4Q60688 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms