Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr2f1Q60632 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms