Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CttnQ60598 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CttnQ60598 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CttnQ60598 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CttnQ60598 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CttnQ60598 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CttnQ60598 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CttnQ60598 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CttnQ60598 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CttnQ60598 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CttnQ60598 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CttnQ60598 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CttnQ60598 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CttnQ60598 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms