Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sin3aQ60520 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sin3aQ60520 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms