Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf123Q5XPI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms