Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q5XFZ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q5XFZ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms