Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms