Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajc11Q5U458 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajc11Q5U458 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms