Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NotoQ5TIS6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms