Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim38Q5SZ99 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim38Q5SZ99 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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