Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Med13Q5SWW4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms