Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms