Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynrgQ5SV85 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynrgQ5SV85 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynrgQ5SV85 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.1 ms