Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fam71bQ5STT6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms