Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf12Q5SPL2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms