Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SynaQ5G5D5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms